故事舞台设定在1600年关原之战14年后。德川家康击败丰臣政权、成为天下霸主后，曾支持丰臣家的武将真田幸村被幽禁于高野山脚下的九度山，与一直暗中以家臣身份追随他的忍者们一同隐姓埋名地生活。
然而，当家康因忌惮年轻的丰臣家当主秀赖起兵反抗，宣布讨伐丰臣家后，局势骤然发生变化。幸村与拥有天才忍术的忍者猿飞佐助相遇，意识到时机已经成熟，于是决定逃离九度山，前往大阪之阵拯救丰臣家。他与一群忠心追随自己的忍者并肩作战，在阴谋、背叛等重重逆境中奋勇反击，同时加深彼此之间的羁绊，最终向家康发起挑战。这是一部以宏大规模描绘一群无名忍者赌上性命展开绝地反击的历史动作故事。